液體處理專(zhuān)家如何自動(dòng)化、標準化捕獲測序文庫制備

目標區域捕獲測序技術(shù)，是根據已知特定基因組區域序列設計寡核苷酸探針，通過(guò)雜交將目標區域捕獲富集進(jìn)行二代測序。其針對目標區域深度測序，增加了檢查靈敏度和準確性。既滿(mǎn)足研究需求，又降低測序成本，在科研、臨床中均備受關(guān)注。

液體處理專(zhuān)家貝克曼庫爾特推出Biomek 自動(dòng)化捕獲測序方案，幫助您實(shí)現自動(dòng)化、標準化的捕獲測序。 由自動(dòng)化工作站進(jìn)行基因捕獲，可以減少手工操作時(shí)間，提高工作效率，增加結果的重復性和均一性。 Biomek工作站可實(shí)現從核酸提取，文庫構建，定量混樣到捕獲的整體實(shí)驗流程。

Figure 1. 捕獲測序文庫構建自動(dòng)化流程

由Biomek成功自動(dòng)化的雜交捕獲試劑盒：

   Agilent HaloPlex™ Target Enrichment - Ion Torrent

   Agilent SureSelect XT®

   Epicentre ScriptSeq® Complete Gold Low Input

   Illumina Nextera® Rapid Capture

   Illumina TruSeq® Exome

   Illumina TruSeq® Rapid Exome

   Illumina TruSight® Cancer

   Illumina TruSight® Tumor 15

   Illumina TruSight® Tumor 170

   IDT xGen® Exome Research Panel

   NEB NEBNext Direct™ Cancer HotSpot Panel

   Roche Nimblegen SeqCap EZ® for Illumina NGS

Biomek自動(dòng)化捕獲測序數據展示

Figure 2. IDT xGen® Exome Research Panel試劑盒捕獲測序文庫制備。

 上圖： 片段分析，其中主峰1和2為雜交捕獲后cfDNA目標片段峰；

 下圖：Qubit Fluorometric Quantification核酸定量結果。

Figure 3. IDT xGen®雜交捕獲試劑盒歷史手工數據vs. 

Biomek i7自動(dòng)化工作站完成數據。A. 平均中靶率，B. 重復率，C. 覆蓋度，D. GC偏移。

Biomek向導式軟件操作界面

在軟件操作界面上用戶(hù)可以選擇樣本數量，是否使用臺面整合的PCR儀，以及運行工作流程的哪個(gè)部分。此外，具備臺面自動(dòng)校對功能，當操作人員完成耗材擺放后，工作站可根據攝像頭拍攝，自動(dòng)判定耗材擺放是否正確，對錯誤擺放位置進(jìn)行提示。避免由于人為擺放耗材錯誤，導致設備碰撞或試劑、時(shí)間損失。

Figure 4. 向導式軟件操作，IDT xGen® 雜交捕獲試劑盒方法選擇界面。

Biomek自動(dòng)化捕獲測序——實(shí)踐速度與通量的飛躍

Figure 5. 完成 24/48/96個(gè)樣本的自動(dòng)化IDT xGen®雜交捕獲測序文庫制備預估耗時(shí)。